Compartiment 7 : carnivores associés

Source des données
Ce compartiment regroupe tous les carnivores qui peuvent utiliser les grottes comme abri contre les prédateurs durant la journée. Ces espèces peuvent être retrouvées également dans d’autres habitats comme des anfractuosités de roches, des petites cavités, des épaves et des récifs artificiels.
Ce compartiment est donc évalué par le nombre d’espèces rencontrées, en séparant néanmoins les poissons et les décapodes. L’abondance des cérianthes est également estimée selon une échelle semi-quantitative à l’entrée de la grotte.
Liste des espèces concernées :
- Conger conger – Congre
- Phycis phycis – Mostelle
- Homarus gammarus – Homard
- Palinurus elephas – Langouste
- Scyllarides latus - Grande cigale de mer
- Arachnanthus oligopodus - Cérianthe strié
- Cerianthus membranaceus – Cérianthe
Protocole de récolte

Le nombre d’espèces de décapodes et de poissons associés est estimé dans la grotte entière. Pour les cérianthes (Cerianthus membranaceus et Arachnanthus oligopodus) une échelle semi-quantitative est utilisée.

Compartiment 6 : carnivores caractéristiques

Source des données
Ce compartiment regroupe tous les carnivores qui sont préférentiellement et/ou fréquemment trouvés dans les grottes sous-marines mais qui peuvent être parfois rencontrés dans d’autres habitats.
Liste des espèces
- Apogon imberbis - Apogon
- Gammogobius steinitzi
- Gobie de Steinitz
- Grammonus ater - Faufré noir
- Scorpaena notata - Petite rascasse rouge
- Thorogobius ephippiatus - Gobie léopard
- Lysmata nilita - Crevette à bande rouge
- Lysmata seticaudata - Crevette nettoyeuse rouge
- Palaemon serratus - Grande crevette rose
- Plesionika narval - Crevette narval
- Stenopus spinosus - Crevette cavernicole
Ces carnivores caractéristiques sont des organismes constamment rencontrés dans les grottes mais avec des densités variables. Ce compartiment est donc évalué par la richesse spécifique des espèces citées en séparant néanmoins la richesse spécifique des poissons de celle des décapodes.
Protocole de récolte

Le nombre d’espèces de décapodes et de poissons caractéristiques est estimé dans la grotte entière.

Compartiment 5 : mysidacés

Source des données
Dans les grottes sous-marines méditerranéennes, les mysidacés sont représentés par 5 espèces au maximum : Hemimysis speluncola, H. margalefi, H. lamornae mediterranea, Harmelinella mariannae et Siriella gracilipes. Du fait de leurs migrations, les mysidacés transportent une grande quantité de matière organique depuis l’extérieur vers l’intérieur de la grotte. Ils constituent une source alimentaire pour les autres types d’organismes par leurs pelotes fécales, leurs carcasses et en étant des proies significatives pour les carnivores présents. Par conséquent, l’équilibre trophique dans une grotte est étroitement lié à l’abondance des mysidacés. Leur diversité est aussi importante pour le transfert de matière organique d’un point à l’autre de la grotte puisque chaque espèce occupe différents habitats au sein de la grotte durant la journée.
Protocole de récolte

L’évaluation des mysidacés est réalisée sur une échelle semi-quantitative de leur abondance. L’acquisition de la donnée est effectuée par l’exploration de la grotte depuis l’entrée jusqu’au fond de la grotte accessible.

Compartiment 4 : détritivores et omnivores

Source des données
Les détritivores et omnivores des grottes semi-obscures sont représentés par les crustacés décapodes, les échinodermes, les mollusques et les annélides.
Les détritivores et omnivores constituent donc un compartiment fondamental des grottes car ils peuvent rendre accessible aux autres types d’organismes les particules nutritives piégées dans le sédiment. En étant reminéralisés, les détritus constituent une source additionnelle nutritive permettant d’atténuer le manque d’éléments nutritifs des grottes.
L’évaluation de ce compartiment est réalisée par la mesure de 2 paramètres. Le premier consiste à évaluer la richesse spécifique des détritivores et omnivores et le second est la mesure du nombre d’individus d’une même espèce durant 5 minutes.
Protocole de récolte
  • Richesse spécifique des détritivores et omnivores :

Évaluer le nombre d’espèces de détritivores et d’omnivores durant l’exploration de la grotte durant 5 min.

  • Nombre d'individus d'une même espèce :

Mesurer le nombre d'individus d'une mêle espèce pendant 5 min.

Compartiment 2 et 3 : filtreurs

Source des données
Les filtreurs des grottes sont représentés par à la fois de petits et de grands organismes, coloniaux ou non coloniaux, et de formes très variables (formes érigées, massives, encroutantes). Les grands filtreurs sont représentés par les bivalves, les ascidies, les éponges massives, et les grands bryozoaires. Les petits filtreurs sont représentés par les serpules, les petits bryozoaires, les éponges encroutantes et les brachiopodes. Ce compartiment est évalué par le pourcentage de recouvrement des organismes à l’aide de photos de recouvrement et par leur stratification verticale
Protocole de récolte
  • Recouvrement :

Le recouvrement des organismes filtreurs est déterminé à partir de photographies standardisées d’une surface comprise entre 1 et 4 m². La surface photographiée sera fonction de la taille de l’entrée de la grotte. Suivant le quadrat et la surface à l'entrée de la grotte, 1 à 16 photographies standardisées sont prises. Les photographies seront prises à quelques mètres de l’entrée de la grotte, à partir de la position où les suspensivores deviennent rares. Afin de ne pas impacter le substrat, un plongeur tient le quadrat et un plongeur prend les photos. Chaque quadrat est ensuite analysé afin d’estimer le recouvrement total des filtreurs pour les organismes de grande taille et de petite taille. L’évaluation finale de ce paramètre est la moyenne du recouvrement des filtreurs dans chaque quadrat photographique.

  • Stratification verticale :

La stratification est évaluée par l’absence de strate (S = 0), la présence d’organismes de quelques millimètres formant une strate (S = 1), la présence de 2 strates avec des organismes mesurant plusieurs centimètres et avec présence de stratification (S = 3) et enfin la présence de 3 strates avec des organismes mesurant plusieurs décimètres (S = 4).

Compartiment 1 : suspensivores

Source des données
Les suspensivores (ou filtreurs passifs) des grottes semi-obscures sont représentés par les cnidaires. Ce compartiment est évalué par le pourcentage de recouvrement des organismes à l’aide de photos de recouvrement et par leur stratification verticale.
Protocole de récolte
  • Recouvrement :

Le recouvrement des organismes suspensivores est déterminé à partir de photographies standardisées d’une surface comprise entre 1 et 4 m² prises à l’entrée de la grotte. La surface photographiée sera fonction de la taille de l’entrée de la grotte. Suivant le quadrat et la surface à l'entrée de la grotte, 1 à 16 photographies standardisées sont prises.

Afin de ne pas impacter le substrat, un plongeur tient le quadrat et un plongeur prend les photos. Chaque quadrat est ensuite analysé afin d’estimer le recouvrement total des suspensivores. L’évaluation finale de ce paramètre est la moyenne du recouvrement des suspensivores dans chaque quadrat photographique.

  • Strates :

La stratification verticale. Les organismes présents dans les grottes sont caractérisés par une sélection de groupes morphologiques présentant une diminution de la taille depuis l’entrée de la grotte jusqu’au fond de la grotte. Cette modification est engendrée par la diminution des éléments nutritifs. Par conséquent, la stratification verticale des organismes sessiles nous renseigne sur la disponibilité en éléments nutritifs pour les suspensivores et les filtreurs dans les grottes. La stratification est donc évaluée par l’absence de strate (S = 0), la présence d’organismes de quelques millimètres formant une strate (S = 1), la présence de 2 strates avec des organismes mesurant plusieurs centimètres et avec présence de stratification (S = 3) et enfin la présence de 3 strates avec des organismes mesurant plusieurs décimètres (S = 4). A noter que le statut 2 n’est pas renseigné pour ce paramètre.